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一個籬笆三個樁——讓PCR管為您做好漢
成大業若烹小鮮-3
對于樣品數量較少或有固定實驗習慣的PCR/qPCR實驗者而言,PCR單管和八聯排管是最常用的PCR耗材選項。使用PCR管進行PCR反應,有兩個操作環節是需注意的:一是反應管的有效密封(見《聯排管蓋操作工具在PCR實驗中應用價值淺析》),二是反應管在樣品模塊上的支持。
所謂PCR管在反應模塊上的支持,是指在樣品模塊上添加必要的支架、支持框類輔助器件,對PCR反應管提供固定、支撐保護,確保在反應過程中所有PCR管受熱均衡,同時,均衡分攤熱蓋的壓力,避免發生樣品管變形、破損。
查閱伯樂和賽默飛PCR儀用戶指南或清點貨物配置清單會發現,伯樂PCR儀隨機配備有Tube Support Ring/Tube Support Frame,而賽默飛PCR儀標配的PCR啟動工具套件(PCR Starter kit)中提供了MicroAmp 96-Well Tray,MicroAmp 96-Well Tray /Retainer Set。這些塑料配件正是PCR反應管的支架。
了解這些支架的使用方法,將有助于充分發揮其為PCR實驗的安全可靠保駕護航的作用。本文以伯樂和賽默飛PCR儀的隨機附件為例,就此問題進行討論。
歸納起來,這類PCR反應管支架可分為2種,即帶蓋PCR管支架和不帶蓋PCR管支架。
一、帶蓋PCR管支架
帶蓋PCR管支架,適用于連接有圓頂或平頂管蓋的PCR單管、PCR 8聯排管或12聯排管。
伯樂T100、S1000、C1000 touch PCR儀配置的Tube Support Ring或Tube Support Frame,為一長方形固定框,可安裝于對應的PCR反應模塊上,沒有固定反應管的功能,主要起平衡熱蓋壓力的作用。
T100 PCR儀反應管支架 96孔快速PCR管支架 96×0.2mL PCR管支架
伯樂MyCycler PCR儀標配了一套上樣托盤/托架(Sample Loading Tray)。這個托架底部與反應模塊匹配,可直接安裝固定在模塊上。內部為96孔的PCR管固定網格,PCR反應管加樣完成后,插入托架網格中予以固定。樣品管上樣結束后,即可合上熱蓋啟動PCR。
因此,托架既是反應管的“頂天柱”-幫著扛壓和防止擠壓變形,又是PCR反應“守護神”,防止樣品管放歪了受熱不勻。可以說,MyCycler這個Sample Loading Tray的功能定位,與目前賽默飛主流的Miniamp/Miniamp Plus、Simpliamp、VeritiPro、Proflex PCR儀及Stepone Plus、Quatistudio系列實時熒光定量PCR儀標配的96孔反應管支架(MicroAmp 96-Well Tray)是異曲同工。
賽默飛PCR管支架的官方示范教程中,操作主要步驟包括:
1.1 將反應管支架安裝與樣品基座上;
1.2 在支架上裝填PCR管并實施反應體系的準備與處理;
1.3 將PCR管-支架整體從基座上輕柔移除,整體轉移至PCR反應模塊上安裝,可立即啟動PCR程序。
二、無帶蓋PCR管支架
無帶蓋PCR管支架,即賽默飛提供的96孔固定器-托盤組合支架(96-Well Tray /Retainer Set)。
該組合支架的上部為PCR管固定器(Retainer),底部為PCR托盤(Tray),兩部分可通過簡單按壓解鎖的鎖扣連接而成。組合支架適用于無管蓋PCR單管或聯排管。
2.1 通過向內側擠壓固定器長邊卡扣解鎖組合支架,將托盤與固定器分離。將托盤安裝于樣品準備基座(如最常用的MicroAmp Splash-Free 96-Well Base)上;
2.2 將PCR管載入托盤和構建PCR體系:根據實驗樣品管數量多少、樣品管在PCR樣品模塊中排位順序,提前組織排列PCR管,并完成PCR樣品加樣處理;
2.3 將固定器開孔與托盤上的反應管對齊后放下,稍微施力下壓固定器的邊框,將固定器與底部托盤鎖緊;
2.4 PCR管密封:將聯排管蓋與樣品孔對齊,用PCR管蓋工具或徒手壓蓋完成反應管密封。最后組裝成型的效果,從下往上依次是:托盤-PCR管-固定器-管蓋;
2.5 將已密封的反應管、固定器-托盤組合支架整體安裝到PCR儀樣品模塊上,啟動PCR。
參考文獻
Sample Loading Tray for the Bio-Rad MyCycler Thermal Cycler