1. 打開PCR儀熱蓋，插入0.2ml的樣品管，蓋好熱蓋。

2. 打開PCR儀電源，儀器程序開始初始化，需等待幾分鐘；初始化完成后，顯示主菜單。

3. 點“Browse/New Methods”，進入PCR程序列表。

4.可直接點一個PCR程序，選擇“Start Run”運行；點右邊的符號，可選擇不同的文件夾。

5. 若要新建一個PCR程序，點“New”，出現PCR程序：

1)添加一段程序：點中上方的“Stage”位置，該位置變紅；再點“Add”，將加入一段新的程序。2)修改循環次數、溫度、時間：點中循環次數、溫度或時間位置，下方出現數字鍵。依次點數字鍵，出現合適數字后，點“Done”確定。

3)添加一個步驟：點“Step”位置，該位置變紅；再點“Add”，軟件將加入一個新的步驟。

4)刪除一個步驟：點“Step”位置，再點“Delete”，軟件將該步驟刪除。

5)建立梯度模式：

a)點中一個步驟，再點“Option”鍵。

b)點“VeriFlex step”，出現梯度創建窗口：輸入6個梯度溫度，溫度下方的“1-2”是指對應的1、2兩行加熱孔，全部輸好后，點“Done”確定（注意：相鄰的兩個梯度溫度之差最大不能超過5℃）。

6）編輯PCR程序完成后，點“Save”保存。

7）點“Run Method”，輸入PCR程序名稱；點，選擇保存PCR程序的文件夾（若要保存在USB中，需先插U盤），再輸入反應體積和熱蓋溫度（這兩項在運行程序時可以修改）。點“SaveδExit”確定。

6. 回到PCR程序列表界面，選擇新建的PCR程序，點“Start Run”出現運行參數設置窗口：輸入反應體積和熱蓋溫度，點“Start Run Now”開始運行。

7. 儀器運行選中的PCR程序，顯示運行監視窗口。

8. 暫停運行：點“Pause Run”，儀器暫停，出現暫停選項欄：“Remaining Time”顯示暫停剩余時間，“ Elapse Time”顯示已暫停時間。若要修改暫停時間，點，輸入時間值，點“Done”確定；點“Resume    Run”結束暫停，繼續運行PCR程序。

9. 終止運行：點“Stop”可以終止整個PCR程序。

10. 反應報告：PCR程序結束后，自動生成反應報告（可保存和打?。?，顯示當次反應的各項指數。

11. PCR反應結束后，打開熱蓋，取出樣品，關閉儀器電源。將儀器開蓋放置，待熱蓋和加熱模塊降至室溫后關上蓋子。